خبر

گذريل ڏهاڪي ۾، جين سيڪوئنسنگ ٽيڪنالاجي کي ڪينسر جي تحقيق ۽ ڪلينڪل مشق ۾ وڏي پيماني تي استعمال ڪيو ويو آهي، جيڪو ڪينسر جي ماليڪيولر خاصيتن کي ظاهر ڪرڻ لاءِ هڪ اهم اوزار بڻجي چڪو آهي. ماليڪيولر تشخيص ۽ ٽارگيٽ ٿيل علاج ۾ ترقي ٽيومر جي درستگي واري علاج جي تصورن جي ترقي کي فروغ ڏنو آهي ۽ ٽيومر جي تشخيص ۽ علاج جي پوري ميدان ۾ وڏيون تبديليون آنديون آهن. جينياتي جانچ کي ڪينسر جي خطري کي ڊيڄارڻ، علاج جي فيصلن جي رهنمائي ڪرڻ ۽ پروگنوسس جو جائزو وٺڻ لاءِ استعمال ڪري سگهجي ٿو، ۽ مريض جي ڪلينڪل نتيجن کي بهتر بڻائڻ لاءِ هڪ اهم اوزار آهي. هتي، اسان CA ڪينسر J Clin، JCO، Ann Oncol ۽ ٻين جرنلز ۾ شايع ٿيل تازين مضمونن جو خلاصو ڪريون ٿا ته جيئن ڪينسر جي تشخيص ۽ علاج ۾ جينياتي جانچ جي درخواست جو جائزو ورتو وڃي.

سوميٽڪ ميوٽيشنز ۽ جراثيم لائن ميوٽيشنز. عام طور تي، ڪينسر ڊي اين اي ميوٽيشنز جي ڪري ٿئي ٿو جيڪي والدين کان ورثي ۾ ملي سگهن ٿا (جراثيم لائن ميوٽيشنز) يا عمر سان حاصل ڪري سگهجن ٿا (سوميٽڪ ميوٽيشنز). جراثيم لائن ميوٽيشنز پيدائش کان موجود آهن، ۽ ميوٽيٽرز عام طور تي جسم جي هر سيل جي ڊي اين اي ۾ ميوٽيشن کڻندا آهن ۽ اولاد ڏانهن منتقل ٿي سگهن ٿا. سوميٽڪ ميوٽيشنز غير گيميٽڪ سيلز ۾ فردن پاران حاصل ڪيا ويندا آهن ۽ عام طور تي اولاد ڏانهن منتقل نه ٿيندا آهن. جراثيم لائن ۽ سوميٽڪ ميوٽيشنز ٻئي سيلز جي عام فنڪشنل سرگرمي کي تباهه ڪري سگهن ٿا ۽ سيلز جي خراب تبديلي جو سبب بڻجي سگهن ٿا. سوميٽڪ ميوٽيشنز خرابي جو هڪ اهم محرڪ آهن ۽ آنڪولوجي ۾ سڀ کان وڌيڪ اڳڪٿي ڪندڙ بايو مارڪر آهن؛ جڏهن ته، تقريبن 10 کان 20 سيڪڙو ٽيومر جا مريض جراثيم لائن ميوٽيشنز کڻندا آهن جيڪي انهن جي ڪينسر جي خطري کي خاص طور تي وڌائين ٿا، ۽ انهن مان ڪجهه ميوٽيشنز علاج معالج پڻ آهن.
ڊرائيور ميوٽيشن ۽ مسافر ميوٽيشن. سڀئي ڊي اين اي قسم سيل جي ڪم کي متاثر نه ڪندا آهن؛ سراسري طور تي، عام سيل جي زوال کي شروع ڪرڻ لاءِ پنج کان ڏهه جينومڪ واقعا لڳن ٿا، جن کي "ڊرائيور ميوٽيشن" جي نالي سان سڃاتو وڃي ٿو. ڊرائيور ميوٽيشن اڪثر ڪري سيل جي زندگي جي سرگرمين سان ويجهي سان لاڳاپيل جين ۾ ٿين ٿا، جهڙوڪ سيل جي واڌ جي ضابطي، ڊي اين اي جي مرمت، سيل سائيڪل ڪنٽرول ۽ ٻين زندگي جي عملن ۾ شامل جين، ۽ انهن کي علاج جي هدفن جي طور تي استعمال ڪرڻ جي صلاحيت هوندي آهي. بهرحال، ڪنهن به ڪينسر ۾ ميوٽيشن جو ڪل تعداد ڪافي وڏو آهي، ڪجهه سينو ڪينسر ۾ ڪجهه هزار کان وٺي ڪجهه انتهائي متغير ڪولوريڪٽل ۽ اينڊوميٽريئل ڪينسر ۾ 100,000 کان وڌيڪ تائين. گهڻن ميوٽيشنز جي ڪا به يا محدود حياتياتي اهميت ناهي، جيتوڻيڪ ميوٽيشن ڪوڊنگ علائقي ۾ ٿئي ٿي، اهڙن غير معمولي ميوٽيشنل واقعن کي "مسافر ميوٽيشن" سڏيو ويندو آهي. جيڪڏهن ڪنهن خاص ٽيومر قسم ۾ هڪ جين قسم علاج جي جواب يا مزاحمت جي اڳڪٿي ڪري ٿو، ته قسم کي ڪلينڪ طور تي قابل عمل سمجهيو ويندو آهي.
آنڪوجينز ۽ ٽيومر کي دٻائيندڙ جين. ڪينسر ۾ اڪثر تبديل ٿيندڙ جين کي تقريبن ٻن قسمن ۾ ورهائي سگهجي ٿو، آنڪوجينز ۽ ٽيومر کي دٻائيندڙ جين. عام سيلن ۾، آنڪوجينز پاران انڪوڊ ٿيل پروٽين بنيادي طور تي سيل جي واڌ کي وڌائڻ ۽ سيل اپوپٽوسس کي روڪڻ جو ڪردار ادا ڪري ٿو، جڏهن ته آنڪوجينز پاران انڪوڊ ٿيل پروٽين بنيادي طور تي سيل ڊويزن کي منفي طور تي منظم ڪرڻ لاءِ ذميوار آهي ته جيئن عام سيل جي ڪم کي برقرار رکي سگهجي. خراب تبديلي جي عمل ۾، جينومڪ ميوٽيشن آنڪوجين سرگرمي کي وڌائڻ ۽ آنڪوجين جي سرگرمي کي گهٽائڻ يا نقصان پهچائي ٿو.
ننڍي تبديلي ۽ بناوت جي تبديلي. اهي جينوم ۾ ميوٽيشن جا ٻه مکيه قسم آهن. ننڍا قسم ڊي اين اي کي تبديل ڪري، ختم ڪري، يا ٿوري تعداد ۾ بيسز شامل ڪري تبديل ڪن ٿا، جن ۾ بيس داخل ڪرڻ، ختم ڪرڻ، فريم شفٽ، ڪوڊون نقصان شروع ڪرڻ، ڪوڊون نقصان جي ميوٽيشن کي روڪڻ، وغيره شامل آهن. بناوت جي تبديلي هڪ وڏي جينوم جي ٻيهر ترتيب آهي، جنهن ۾ جين جا حصا شامل آهن جيڪي سائيز ۾ ڪجهه هزار بيسز کان وٺي ڪروموزوم جي اڪثريت تائين آهن، جن ۾ جين ڪاپي نمبر تبديليون، ڪروموزوم حذف ڪرڻ، نقل، الٽ يا ٽرانسلوڪشن شامل آهن. اهي ميوٽيشن پروٽين جي ڪم ۾ گهٽتائي يا واڌ جو سبب بڻجي سگهن ٿا. انفرادي جين جي سطح تي تبديلين کان علاوه، جينومڪ دستخط پڻ ڪلينڪل ترتيب جي رپورٽن جو حصو آهن. جينومڪ دستخطن کي ننڍڙن ۽/يا بناوت جي مختلف تبديلين جي پيچيده نمونن طور ڏسي سگهجي ٿو، جنهن ۾ ٽيومر ميوٽيشن لوڊ (TMB)، مائڪرو سيٽلائيٽ عدم استحڪام (MSI)، ۽ هوموگس ري ڪمبينيشن خرابيون شامل آهن.

ڪلونل ميوٽيشن ۽ سب ڪلونل ميوٽيشن. ڪلونل ميوٽيشن سڀني ٽيومر سيلز ۾ موجود آهن، تشخيص وقت موجود آهن، ۽ علاج جي اڳتي وڌڻ کان پوءِ به موجود رهن ٿا. تنهن ڪري، ڪلونل ميوٽيشنز ۾ ٽيومر جي علاج جي هدفن جي طور تي استعمال ٿيڻ جي صلاحيت آهي. سب ڪلونل ميوٽيشنز صرف ڪينسر سيلز جي هڪ ذيلي سيٽ ۾ موجود آهن ۽ تشخيص جي شروعات ۾ ڳولي سگهجن ٿيون، پر بعد ۾ ٻيهر ٿيڻ سان غائب ٿي وڃن ٿيون يا علاج کان پوءِ ئي ظاهر ٿين ٿيون. ڪينسر جي هيٽروجينيٽي هڪ ئي ڪينسر ۾ ڪيترن ئي سب ڪلونل ميوٽيشنز جي موجودگي کي ظاهر ڪري ٿي. خاص طور تي، سڀني عام ڪينسر جي نسلن ۾ ڪلينڪ طور تي اهم ڊرائيور ميوٽيشنز جي وڏي اڪثريت ڪلونل ميوٽيشنز آهن ۽ ڪينسر جي ترقي دوران مستحڪم رهنديون آهن. مزاحمت، جيڪا اڪثر سب ڪلونز ذريعي وچولي هوندي آهي، تشخيص جي وقت تي نه ڳولي سگهجي ٿي پر ظاهر ٿئي ٿي جڏهن اهو علاج کان پوءِ ٻيهر ٿئي ٿو.

روايتي ٽيڪنڪ FISH يا سيل ڪيريو ٽائپ ڪروموسومل سطح تي تبديلين کي ڳولڻ لاءِ استعمال ڪئي ويندي آهي. FISH کي جين فيوزن، ڊيليٽيشن، ۽ ايمپليفڪيشن کي ڳولڻ لاءِ استعمال ڪري سگهجي ٿو، ۽ اهڙين قسمن کي ڳولڻ لاءِ "گولڊ اسٽينڊرڊ" سمجهيو ويندو آهي، اعليٰ درستگي ۽ حساسيت سان پر محدود ٿرو پُٽ سان. ڪجهه هيماتولوجڪ خرابين ۾، خاص طور تي ايڪيوٽ ليوڪيميا ۾، ڪيريو ٽائپنگ اڃا تائين تشخيص ۽ پروگنوسس جي رهنمائي لاءِ استعمال ڪئي ويندي آهي، پر هن ٽيڪنڪ کي بتدريج ٽارگيٽ ڪيل ماليڪيولر ايسيز جهڙوڪ FISH، WGS، ۽ NGS سان تبديل ڪيو پيو وڃي.
انفرادي جين ۾ تبديليون پي سي آر ذريعي ڳولي سگهجن ٿيون، ريئل ٽائيم پي سي آر ۽ ڊجيٽل ڊراپ پي سي آر ٻئي. انهن طريقن ۾ اعليٰ حساسيت آهي، خاص طور تي ننڍڙن باقي بچيل زخمن جي ڳولا ۽ نگراني لاءِ موزون آهن، ۽ نسبتاً مختصر وقت ۾ نتيجا حاصل ڪري سگهن ٿيون، نقصان اهو آهي ته ڳولا جي حد محدود آهي (عام طور تي صرف هڪ يا ڪجهه جين ۾ ميوٽيشنز کي ڳوليندا آهن)، ۽ ڪيترن ئي ٽيسٽن جي صلاحيت محدود آهي.
اميونوهسٽو ڪيمسٽري (IHC) هڪ پروٽين تي ٻڌل نگراني وارو اوزار آهي جيڪو عام طور تي ERBB2 (HER2) ۽ ايسٽروجن ريڪٽرز جهڙن بايو مارڪرز جي اظهار کي ڳولڻ لاءِ استعمال ڪيو ويندو آهي. IHC کي مخصوص ميوٽيٽيڊ پروٽين (جهڙوڪ BRAF V600E) ۽ مخصوص جين فيوزن (جهڙوڪ ALK فيوزن) کي ڳولڻ لاءِ پڻ استعمال ڪري سگهجي ٿو. IHC جو فائدو اهو آهي ته ان کي آساني سان معمول جي ٽشو تجزيي جي عمل ۾ ضم ڪري سگهجي ٿو، تنهنڪري ان کي ٻين ٽيسٽن سان گڏ ڪري سگهجي ٿو. ان کان علاوه، IHC سب سيلولر پروٽين لوڪلائيزيشن تي معلومات مهيا ڪري سگهي ٿو. نقصان محدود اسڪيليبلٽي ۽ اعليٰ تنظيمي مطالبا آهن.
ٻئي نسل جي ترتيب (NGS) NGS ڊي اين اي ۽/يا آر اين اي سطح تي تبديلين کي ڳولڻ لاءِ اعليٰ-ٿرو پُٽ متوازي ترتيب جي ٽيڪنڪ استعمال ڪري ٿو. هي ٽيڪنڪ پوري جينوم (WGS) ۽ دلچسپي جي جين علائقن ٻنهي کي ترتيب ڏيڻ لاءِ استعمال ڪري سگهجي ٿي. WGS سڀ کان وڌيڪ جامع جينومڪ ميوٽيشن جي معلومات فراهم ڪري ٿو، پر ان جي ڪلينڪل ايپليڪيشن ۾ ڪيتريون ئي رڪاوٽون آهن، جن ۾ تازي ٽامي جي ٽشو نمونن جي ضرورت (WGS اڃا تائين فارملين-غير متحرڪ نمونن جي تجزيو لاءِ مناسب ناهي) ۽ وڏي قيمت شامل آهي.
ٽارگيٽڊ اين جي ايس سيڪوئنسنگ ۾ پوري ايڪسون سيڪوئنسنگ ۽ ٽارگيٽ جين پينل شامل آهن. اهي ٽيسٽ ڊي اين اي پروبس يا پي سي آر ايمپليفڪيشن ذريعي دلچسپي جي علائقن کي مالا مال ڪن ٿا، ان ڪري گهربل سيڪوئنسنگ جي مقدار کي محدود ڪن ٿا (سڄو ايڪسوم جينوم جو 1 کان 2 سيڪڙو ٺاهيندو آهي، ۽ 500 جين تي مشتمل وڏا پينل به جينوم جو صرف 0.1 سيڪڙو ٺاهيندا آهن). جيتوڻيڪ پوري ايڪسون سيڪوئنسنگ فارملين-فڪسڊ ٽشوز ۾ سٺي ڪارڪردگي ڏيکاري ٿي، ان جي قيمت وڌيڪ رهي ٿي. ٽارگيٽ جين جو مجموعو نسبتاً اقتصادي آهي ۽ جين کي چونڊڻ ۾ لچڪداريءَ جي اجازت ڏئي ٿو ته جيئن ٽيسٽ ڪئي وڃي. ان کان علاوه، گردش ڪندڙ مفت ڊي اين اي (cfDNA) ڪينسر جي مريضن جي جينومڪ تجزيي لاءِ هڪ نئين آپشن طور اڀري رهيو آهي، جنهن کي مائع بايوپسي سڏيو ويندو آهي. ڪينسر سيلز ۽ عام سيلز ٻئي رت جي وهڪري ۾ ڊي اين اي جاري ڪري سگهن ٿا، ۽ ڪينسر سيلز مان نڪرندڙ ڊي اين اي کي گردش ڪندڙ ٽيومر ڊي اين اي (ctDNA) سڏيو ويندو آهي، جنهن جو تجزيو ڪري ٽيومر سيلز ۾ امڪاني ميوٽيشنز کي ڳولڻ لاءِ ڪري سگهجي ٿو.
ٽيسٽ جو انتخاب مخصوص ڪلينڪل مسئلي تي منحصر آهي جنهن کي حل ڪيو وڃي. منظور ٿيل علاج سان لاڳاپيل گھڻا بايو مارڪرز FISH، IHC، ۽ PCR ٽيڪنڪ ذريعي ڳولي سگھجن ٿا. اهي طريقا ننڍي مقدار ۾ بايو مارڪرز جي ڳولا لاءِ مناسب آهن، پر اهي وڌندڙ ٿرو پُٽ سان ڳولا جي ڪارڪردگي کي بهتر نه ٿا ڪن، ۽ جيڪڏهن تمام گهڻا بايو مارڪرز ڳوليا وڃن، ته شايد ڳولا لاءِ ڪافي ٽشو نه هجن. ڪجهه مخصوص ڪينسر ۾، جهڙوڪ ڦڦڙن جي ڪينسر، جتي ٽشو جا نمونا حاصل ڪرڻ مشڪل آهن ۽ ٽيسٽ ڪرڻ لاءِ ڪيترائي بايو مارڪرز آهن، NGS استعمال ڪرڻ هڪ بهتر انتخاب آهي. نتيجي ۾، امتحان جو انتخاب هر مريض لاءِ ٽيسٽ ڪرڻ لاءِ بايو مارڪرز جي تعداد ۽ بايو مارڪر لاءِ ٽيسٽ ڪرڻ لاءِ مريضن جي تعداد تي منحصر آهي. ڪجهه حالتن ۾، IHC/FISH جو استعمال ڪافي آهي، خاص طور تي جڏهن ٽارگيٽ جي سڃاڻپ ڪئي وئي هجي، جهڙوڪ سيني جي ڪينسر جي مريضن ۾ ايسٽروجن ريڪٽرز، پروجيسٽرون ريڪٽرز، ۽ ERBB2 جي ڳولا. جيڪڏهن جينومڪ ميوٽيشنز جي وڌيڪ جامع ڳولا ۽ امڪاني علاج جي هدفن جي ڳولا جي ضرورت هجي، ته NGS وڌيڪ منظم ۽ قيمتي اثرائتي آهي. ان کان علاوه، اين جي ايس تي غور ڪري سگهجي ٿو انهن ڪيسن ۾ جتي IHC/FISH جا نتيجا مبهم يا غير حتمي آهن..

مختلف هدايتون هدايتون ڏين ٿيون ته ڪهڙا مريض جينياتي جانچ لاءِ اهل هجڻ گهرجن. 2020 ۾، ESMO پريسيشن ميڊيسن ورڪنگ گروپ ترقي يافته ڪينسر جي مريضن لاءِ پهرين NGS ٽيسٽنگ سفارشون جاري ڪيون، ترقي يافته غير اسڪوامس غير ننڍي سيل ڦڦڙن جي ڪينسر، پروسٽيٽ ​​ڪينسر، ڪولوريڪٽل ڪينسر، بائل ڊڪٽ ڪينسر، ۽ رحم جي ڪينسر جي ٽيومر جي نمونن لاءِ معمول جي NGS ٽيسٽنگ جي سفارش ڪئي، ۽ 2024 ۾، ESMO هن بنياد تي اپڊيٽ ڪيو، سيني جي ڪينسر ۽ ناياب ٽيومر کي شامل ڪرڻ جي سفارش ڪئي. جهڙوڪ گيسٽرو انٽيسٽينل اسٽرومل ٽيومر، سارڪوما، ٿائرائيڊ ڪينسر ۽ نامعلوم اصل جا ڪينسر.
2022 ۾، ميٽاسٽڪ يا ايڊوانسڊ ڪينسر وارن مريضن ۾ سوميٽڪ جينوم ٽيسٽنگ تي ASCO جي ڪلينڪل راءِ ۾ چيو ويو آهي ته جيڪڏهن ميٽاسٽڪ يا ايڊوانسڊ سولڊ ٽيومر وارن مريضن ۾ بايو مارڪر سان لاڳاپيل علاج منظور ڪيو وڃي ٿو، ته انهن مريضن لاءِ جينياتي جانچ جي سفارش ڪئي ويندي آهي. مثال طور، BRAF V600E ميوٽيشنز جي اسڪريننگ لاءِ ميٽاسٽڪ ميلانوما وارن مريضن ۾ جينومڪ ٽيسٽنگ ڪرڻ گهرجي، ڇاڪاڻ ته RAF ۽ MEK انابيٽرز هن اشاري لاءِ منظور ٿيل آهن. ان کان علاوه، جينياتي ٽيسٽنگ پڻ ڪرڻ گهرجي جيڪڏهن مريض کي دوا ڏيڻ لاءِ مزاحمت جو واضح نشان موجود هجي. مثال طور، Egfrmab، KRAS ميوٽنٽ ڪولوريڪٽل ڪينسر ۾ غير موثر آهي. جين سيڪوئنسنگ لاءِ مريض جي موزونيت تي غور ڪرڻ وقت، مريض جي جسماني حيثيت، ڪاموربيڊيٽيز، ۽ ٽيومر اسٽيج کي ضم ڪيو وڃي، ڇاڪاڻ ته جينوم سيڪوئنسنگ لاءِ گهربل قدمن جو سلسلو، جنهن ۾ مريض جي رضامندي، ليبارٽري پروسيسنگ، ۽ سيڪوئنسنگ نتيجن جو تجزيو شامل آهي، مريض کي مناسب جسماني صلاحيت ۽ زندگي جي توقع جي ضرورت هوندي آهي.
سوميٽڪ ميوٽيشنز کان علاوه، ڪجهه ڪينسر کي جراثيم جين لاءِ پڻ جانچڻ گهرجي. جراثيم لائن ميوٽيشنز جي جاچ سيني، رحم، پروسٽيٽ، ۽ پينڪريٽڪ ڪينسر ۾ BRCA1 ۽ BRCA2 ميوٽيشنز جهڙن ڪينسرن جي علاج جي فيصلن تي اثرانداز ٿي سگهي ٿي. جراثيم لائن ميوٽيشنز مستقبل ۾ ڪينسر جي اسڪريننگ ۽ مريضن ۾ روڪٿام لاءِ پڻ اثرانداز ٿي سگهن ٿا. اهي مريض جيڪي جراثيم لائن ميوٽيشنز جي جاچ لاءِ ممڪن طور تي موزون آهن انهن کي ڪجهه شرطن کي پورو ڪرڻ جي ضرورت آهي، جنهن ۾ ڪينسر جي خانداني تاريخ، تشخيص جي وقت عمر، ۽ ڪينسر جي قسم جهڙا عنصر شامل آهن. بهرحال، ڪيترائي مريض (50٪ تائين) جيڪي جراثيم لائن ۾ پيٿوجينڪ ميوٽيشنز کڻندا آهن اهي خانداني تاريخ جي بنياد تي جراثيم لائن ميوٽيشنز جي جاچ لاءِ روايتي معيار تي پورا نه لهندا آهن. تنهن ڪري، ميوٽيشن ڪيريئرز جي سڃاڻپ کي وڌائڻ لاءِ، نيشنل ڪمپريهينسو ڪينسر نيٽ ورڪ (NCCN) سفارش ڪري ٿو ته سيني، رحم، اينڊوميٽريل، پينڪريٽڪ، ڪولوريڪٽل، يا پروسٽيٽ ​​ڪينسر سان گڏ سڀني يا گهڻن مريضن کي جراثيم لائن ميوٽيشنز لاءِ ٽيسٽ ڪيو وڃي.
جينياتي جانچ جي وقت جي حوالي سان، ڇاڪاڻ ته ڪلينڪ طور تي اهم ڊرائيور ميوٽيشنز جي وڏي اڪثريت ڪلونل آهي ۽ ڪينسر جي ترقي جي دوران نسبتا مستحڪم آهي، اهو مناسب آهي ته ترقي يافته ڪينسر جي تشخيص جي وقت مريضن تي جينياتي جانچ ڪئي وڃي. بعد ۾ جينياتي جانچ لاءِ، خاص طور تي ماليڪيولر ٽارگيٽڊ ٿراپي کان پوءِ، ctDNA ٽيسٽنگ ٽيومر ٽشو ڊي اين اي کان وڌيڪ فائديمند آهي، ڇاڪاڻ ته رت جي ڊي اين اي ۾ سڀني ٽيومر زخمن مان ڊي اين اي شامل ٿي سگهي ٿو، جيڪو ٽيومر جي هيٽروجنيٽي بابت معلومات حاصل ڪرڻ لاءِ وڌيڪ سازگار آهي.
علاج کان پوءِ ctDNA جو تجزيو علاج لاءِ ٽيومر جي جواب جي اڳڪٿي ڪرڻ ۽ معياري تصويري طريقن کان اڳ بيماري جي ترقي جي سڃاڻپ ڪرڻ جي قابل ٿي سگھي ٿو. بهرحال، علاج جي فيصلن جي رهنمائي لاءِ انهن ڊيٽا کي استعمال ڪرڻ لاءِ پروٽوڪول قائم نه ڪيا ويا آهن، ۽ ctDNA تجزيو ڪلينڪل ٽرائلز کان سواءِ سفارش نه ڪئي وئي آهي. ctDNA کي ريڊيڪل ٽيومر سرجري کان پوءِ ننڍڙن باقي بچيل زخمن جو جائزو وٺڻ لاءِ پڻ استعمال ڪري سگهجي ٿو. سرجري کان پوءِ ctDNA ٽيسٽنگ بعد ۾ بيماري جي ترقي جو هڪ مضبوط اڳڪٿي ڪندڙ آهي ۽ اهو طئي ڪرڻ ۾ مدد ڪري سگهي ٿي ته ڇا مريض ايڊجوونٽ ڪيموٿراپي مان فائدو حاصل ڪندو، پر اڃا تائين ڪلينڪل ٽرائلز کان ٻاهر ايڊجوونٽ ڪيموٿراپي جي فيصلن جي رهنمائي لاءِ ctDNA استعمال ڪرڻ جي سفارش نه ڪئي وئي آهي.

ڊيٽا پروسيسنگ جينوم سيڪوئنسنگ ۾ پهريون قدم مريضن جي نمونن مان ڊي اين اي ڪڍڻ، لائبريريون تيار ڪرڻ، ۽ خام سيڪوئنسنگ ڊيٽا تيار ڪرڻ آهي. خام ڊيٽا کي وڌيڪ پروسيسنگ جي ضرورت آهي، جنهن ۾ گهٽ معيار جي ڊيٽا کي فلٽر ڪرڻ، ريفرنس جينوم سان ان جو مقابلو ڪرڻ، مختلف تجزياتي الگورتھم ذريعي مختلف قسمن جي ميوٽيشنز جي سڃاڻپ ڪرڻ، پروٽين جي ترجمي تي انهن ميوٽيشنز جي اثر جو تعين ڪرڻ، ۽ جراثيم لائن ميوٽيشنز کي فلٽر ڪرڻ شامل آهن.
ڊرائيور جين اينوٽيشن ڊرائيور ۽ مسافر ميوٽيشنز کي فرق ڪرڻ لاءِ ٺهيل آهي. ڊرائيور ميوٽيشنز ٽيومر سپريسر جين جي سرگرمي جي نقصان يا واڌ جو سبب بڻجن ٿا. ننڍڙا قسم جيڪي ٽيومر سپريسر جين جي غير فعال ٿيڻ جو سبب بڻجن ٿا انهن ۾ بي معنيٰ ميوٽيشنز، فريم شفٽ ميوٽيشنز، ۽ ڪي اسپلسنگ سائيٽ ميوٽيشنز، انهي سان گڏ گهٽ بار بار شروع ٿيندڙ ڪوڊون ڊيليٽيشن، اسٽاپ ڪوڊون ڊيليٽيشن، ۽ انٽرون انسرشن/ڊيليٽيشن ميوٽيشنز جي وسيع رينج شامل آهن. ان کان علاوه، غلط فهمي ميوٽيشنز ۽ ننڍي انٽرون انسرشن/ڊيليٽيشن ميوٽيشنز اهم فنڪشنل ڊومينز کي متاثر ڪرڻ وقت ٽيومر سپريسر جين جي سرگرمي جي نقصان جو سبب بڻجي سگهن ٿيون. ساختي قسم جيڪي ٽيومر سپريسر جين جي سرگرمي جي نقصان جو سبب بڻجن ٿا انهن ۾ جزوي يا مڪمل جين ڊيليٽيشن ۽ ٻيا جينومڪ قسم شامل آهن جيڪي جين پڙهڻ واري فريم جي تباهي جو سبب بڻجن ٿا. ننڍڙا قسم جيڪي آنڪوجينز جي بهتر ڪم جي طرف وٺي وڃن ٿا انهن ۾ غلط فهمي ميوٽيشنز ۽ ڪڏهن ڪڏهن انٽرون انسرشن/ڊيليٽيشن شامل آهن جيڪي اهم پروٽين فنڪشنل ڊومينز کي نشانو بڻائين ٿا. نادر ڪيسن ۾، پروٽين ٽرنڪشن يا اسپلسنگ سائيٽ ميوٽيشنز آنڪوجينز جي چالو ٿيڻ جو سبب بڻجي سگهن ٿا. ساختي تبديليون جيڪي آنڪوجين ايڪٽيويشن جو سبب بڻجن ٿيون انهن ۾ جين فيوزن، جين ڊيليٽيشن، ۽ جين ڊپلڪشن شامل آهن.
جينومڪ تبديلي جي ڪلينڪل تشريح سڃاڻپ ٿيل ميوٽيشنز جي ڪلينڪل اهميت جو جائزو وٺندي آهي، يعني انهن جي امڪاني تشخيصي، پيشنگوئي، يا علاج جي قدر. ڪيترائي ثبوت تي ٻڌل گريڊنگ سسٽم آهن جيڪي جينومڪ تبديلي جي ڪلينڪل تشريح جي رهنمائي ڪرڻ لاءِ استعمال ڪري سگهجن ٿا.
ميموريل سلوان-ڪيٽرنگ ڪينسر سينٽر جو پريسيشن ميڊيسن آنڪولوجي ڊيٽابيس (آنڪو ڪي بي) جين جي مختلف قسمن کي دوا جي استعمال لاءِ انهن جي اڳڪٿي واري قدر جي بنياد تي چار سطحن ۾ ورهائي ٿو: ليول 1/2، ايف ڊي اي-منظور ٿيل، يا ڪلينڪ طور تي معياري بايو مارڪر جيڪي منظور ٿيل دوا جي مخصوص اشاري جي جواب جي اڳڪٿي ڪن ٿا؛ ليول 3، ايف ڊي اي-منظور ٿيل يا غير منظور ٿيل بايو مارڪر جيڪي ناول ٽارگيٽڊ دوائن جي جواب جي اڳڪٿي ڪن ٿا جيڪي ڪلينڪل ٽرائلز ۾ واعدو ڏيکاريا آهن، ۽ ليول 4، غير ايف ڊي اي-منظور ٿيل بايو مارڪر جيڪي ناول ٽارگيٽڊ دوائن جي جواب جي اڳڪٿي ڪن ٿا جيڪي ڪلينڪل ٽرائلز ۾ قائل ڪندڙ حياتياتي ثبوت ڏيکاريا آهن. علاج جي مزاحمت سان لاڳاپيل هڪ پنجون ذيلي گروپ شامل ڪيو ويو.
آمريڪي سوسائٽي فار ماليڪيولر پيٿولوجي (AMP)/آمريڪي سوسائٽي آف ڪلينڪل آنڪولوجي (ASCO)/ڪاليج آف آمريڪن پيٿولوجسٽس (CAP) جون هدايتون سوميٽڪ ويريشن جي تشريح لاءِ سوميٽڪ ويريشن کي چئن درجن ۾ ورهائين ٿيون: گريڊ I، مضبوط ڪلينڪل اهميت سان؛ گريڊ II، امڪاني ڪلينڪل اهميت سان؛ گريڊ III، ڪلينڪل اهميت نامعلوم؛ گريڊ IV، ڪلينڪل اهميت جي طور تي نه سڃاتو وڃي ٿو. علاج جي فيصلن لاءِ صرف گريڊ I ۽ II قسم قيمتي آهن.
ESMO جو ماليڪيولر ٽارگيٽ ڪلينڪل آپريبلٽي اسڪيل (ESCAT) جين جي مختلف قسمن کي ڇهن سطحن ۾ ورهائي ٿو: سطح I، معمول جي استعمال لاءِ مناسب هدف؛ مرحلو II، هڪ هدف جيڪو اڃا تائين مطالعو ڪيو پيو وڃي، ممڪن آهي ته مريض جي آبادي کي اسڪرين ڪرڻ لاءِ استعمال ڪيو وڃي جيڪو ٽارگيٽ دوا مان فائدو حاصل ڪري سگهي ٿو، پر ان جي حمايت لاءِ وڌيڪ ڊيٽا جي ضرورت آهي. گريڊ III، ٽارگيٽ ٿيل جين مختلف قسمن جيڪي ٻين ڪينسر جي نسلن ۾ ڪلينڪل فائدي جو مظاهرو ڪيو آهي؛ گريڊ IV، صرف ٽارگيٽ ٿيل جين مختلف قسمن کي پري ڪلينڪل ثبوتن جي حمايت ڪئي وئي آهي؛ گريڊ V ۾، ميوٽيشن کي نشانو بڻائڻ جي ڪلينڪل اهميت جي حمايت ڪرڻ لاءِ ثبوت موجود آهن، پر ٽارگيٽ جي خلاف سنگل ڊرگ ٿراپي بقا کي نه وڌائيندي آهي، يا گڏيل علاج جي حڪمت عملي اختيار ڪري سگهجي ٿي؛ گريڊ X، ڪلينڪل قدر جي کوٽ.